国内百日咳发病数增加也被认为与前述三个原因有关。例如，湖北疾控一篇分析该省百日咳流行情况的论文中提到，当地前几年开始百日咳发病率明显上升，且主要集中在0-5岁儿童中。值得一提的是，湖北省2020年后学生报告百日咳占比明显增加，作者认为可能是因为新冠防控使得在校学生出现类似传染病症状后到医疗机构的就诊更加规范,学生病例被更多地发现有关。